Изучение ассоциации полиморфизма P187S гена NQO1 с развитием врожденного дефекта межпредсердной перегородки сердца в Краснодарском крае

Тип работы:
Реферат
Предмет:
Медицина


Узнать стоимость

Детальная информация о работе

Выдержка из работы

Международный Научный Институт & quot-Educatio"- VII (14), 2015
144
БИОЛОГИЧЕСКИЕ НАУКИ
ИЗУЧЕНИЕ АССОЦИАЦИИ ПОЛИМОРФИЗМА P187S ГЕНА NQO1 С РАЗВИТИЕМ ВРОЖДЕННОГО ДЕФЕКТА МЕЖПРЕДСЕРДНОЙ ПЕРЕГОРОДКИ СЕРДЦА
В КРАСНОДАРСКОМ КРАЕ
Швецов Ярослав Дмитриевич
Заочный аспирант кафедры биологии, медицинской генетики и экологии Курского государственного медицинского университета, г. Курск
Лазарев Константин Юрьевич К. м. н., доцент кафедры биологии с курсом медицинской генетики Кубанского государственного медицинского университета, г. Краснодар
Полоников Алексей Валерьевич Д.м.н., профессор кафедры биологии, медицинской генетики и экологии Курского государственного медицинского университета, г. Курск
ASSOCIA TION STUDY OF POLYMORPHISM P187S OF THE NQO1 GENE WITH THE DEVELOPMENT OF CONGENITAL ATRIAL SEPTAL DEFECT OF HEART IN KRASNODAR REGION
Shvetsov Yaroslav Dmitrievich, The postgraduate student of faculty of biology, medical genetics and ecology of Kursk state medical university, Kursk
Lazarev Konstantin Yurievich, Candidate of Medical Science, Assistant Professor of biology with a course of medical genetics of the Kuban State Medical University, Krasnodar
Polonikov Alexey Valerevich, Doktor of medical sciences, the professor offaculty of biology, medical genetics and ecology of Kursk state medical university, Kursk АННОТАЦИЯ
Целью исследования было изучение ассоциации полиморфизма P187S гена NQO1 с развитием врожденного дефекта межпредсердной перегородки сердца (ДМПП). Материалом для исследования послужили образцы ДНК 48 неродственных детей славянского происхождения с ДМПП, рожденных в родильных домах Краснодарского края и 232 здоровых родителей. Генотипирование полиморфизма P187S гена NQO1 проводили методом ПЦР real time с использованием TaqMan-зондов. Сравнительный анализ частот аллелей и генотипов между группами больных детей и здоровых родителей не выявил ассоциации с развитием ДМПП.
ABSTRACT
The study investigated an association between polymorphism P187S of the NQO1 gene and the risk of congenital atrial septal defect (ASD). We investigated DNA samples obtained from 48 unrelated children of Slavic origin with ASD and 232 healthy parents. Genotyping ofpolymorphism P187S of the NQO1 gene was performed through a real time PCR with TaqMan-probes. A comparative analysis of the frequencies of alleles and genotypes showed no association with the development of ASD in both entire groups.
Ключевые слова: врожденный дефект межпредсердной перегородки сердца- ДНК-полиморфизм- NQO1. Keywords: congenital atrial septal defect septal defect of the heart- DNA-polymorphism- NQO1.
Среди всех врожденных дефектов врожденные пороки сердца являются самыми распространенными. Врожденные пороки сердца (ВПС) наблюдаются с частотой 8 на 1000, или 1 на 125 живорожденных новорожденных. На сегодняшний день известно более 35 типов различных врожденных пороков сердца. Чаще всего встречается дефект межжелудочковой перегородки (от 30 до 50% всех врожденных пороков сердца), открытый артериальный проток выявляется в 10% случаев. Удельный вес дефекта межпредсердной перегородки, стеноза легочной артерии, коарктации аорты, тетрады Фалло, транспозиции магистральных сосудов, стеноза аорты и атриовентрикулярной коммуникации (без трисомии по 21 хромосоме) не превышает 5−7% по каждому из пороков. Другие врожденные пороки сердца регистрируются с частотой менее 1−2% [3, с. 1800].
Дефект межпредсердной перегородки — врожденная аномальная коммуникация между левым и правым предсердием. ДМПП у детей наблюдается в 7% случаев среди всех ВПС, или у 1 на 1500 живорожденных. У взрослых пациентов ДМПП составляет 46% среди всех ВПС. Примерно 15 -30% здоровых детей и подростков имеют нефункционирующее овальное окно, при котором клапан овального окна не срастается с перегородкой.
Многие ученые связывают развитие аномалий сердца с воздействием на человека неблагоприятных факторов окружающей среды (химических, физических, биологических тератогенов), которые, действуя на организм плода, вызывают формирование пороков развития.
НАД (Ф)Н-хинон оксидоредуктаза 1 NQO1- цитозольный фермент, катализирующий двухэлектронное восстановление соединений хинона и предотвращающий образование свободных радикалов семихинона, а также активных молекул кислорода, защищая таким образом клетку от окислительного стресса [2, с. 12]. Ген NQO1 локализован на 16-й хромосоме в локусе 16q22.1. Один из полиморфных вариантов этого гена, характеризующийся однонуклеотидной заменой цитозина на тимин в 609-м положении (609C& gt-T, rs1800566), согласно литературным данным, ассоциирован с повышенной чувствительностью индивидов к воздействию химических факторов [1, с. 799].
Целью настоящего исследования было изучение роли полиморфного варианта Pro187Ser гена NQO1 в формировании врожденного дефекта межпредсердной перегородки сердца плода в Краснодарской популяции.
Материалом для исследования послужила выборка детей славянского происхождения (преимущественно русской национальности) из 44 административных образований Краснодарского края, родившихся в период 19 982 012 гг., не состоявших в родственной связи друг с другом. В исследование было включено 280 человек. Объектом исследования были больные дети с дефектами межпредсердной перегородки сердца (n=48) и здоровые родители, составляющую группу контроля (n=232), не имеющих врожденных пороков развития. Средний возраст детей с ДМПП составил 3,10±0,14 лет (15 мальчиков — 31,3% и 33 девочки — 68,7%). Включение в группу больных с
Международный Научный Институт & quot-Educatio"- VII (14), 2015
145
БИОЛОГИЧЕСКИЕ НАУКИ
ВПС осуществлялось только после верификации диагноза комплексом методов обследования.
У всех обследуемых проводился забор венозной крови из кубитальной вены, выделение геномной ДНК осуществляли стандартным методом фенольно-хлороформной экстракции. Генотипирование полиморфизма P187S гена NQO1 осуществлялось методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени и дискриминации аллелей с помощью TaqMan-зондов на амплифика-торе CFX96 фирмы Bio-Rad (США) путем индивидуального подбора соответствующих условий ПЦР путем титрования для исследуемого ДНК-маркера. Для оценки соответствия распределения частот генотипов исследуемого полиморфизма гена NQO1 ожидаемым значениям при равновесии Харди-Вайнберга (РХВ) и для сравнения распределений частот аллелей и генотипов в выборках больных ДМПП и здоровых родителей использовали критерий х2 Пирсона с поправкой Йетса на непрерывность. Об ассоциации аллелей или генотипов с предрасположенностью к ВПС судили по величине отношения шансов (OR), границам 95%-ного доверительного интервала (Cl) для OR. Ста-
тистическая обработка данных проводилась на персональном компьютере с использованием программных пакетов Statistica 6.0 («StatSoft») и Ехсе1 2010 («Microsoft»).
Распределение частот генотипов изучаемого полиморфизма и его соответствие популяционному равновесию Харди-Вайнберга проводилось раздельно в группе детей с ДМПП и в контрольной группе. Установлено, что статистически значимого отклонения в распределении частот аллелей и генотипов NQO1 от равновесия Харди-Вайнберга, ни в группе больных ВПС, ни в группе контроля не обнаружено (р& gt-0,05). Учитывая возможность полового диморфизма, представлялось важным провести стратифицированный анализ ассоциаций полиморфизма P187S гена NQO1 раздельно у девочек и мальчиков (Таблица 1). Как видно из таблицы 1, аллели и генотипы полиморфизма P187S гена NQO1 не были ассоциированы с риском развития ДМПП.
Таким образом, нами не была выявлена взаимосвязь полиморфизма, тем не менее, нельзя исключить возможность участия гена NQO1 в формировании наследственной предрасположенности к врожденным порокам сердца.
Таблица 1
Распределение частот аллелей и генотипов полиморфизма P187S гена NQO1 у больных с ДМПП
и здоровых родителей
Аллели Частоты аллелей Критерий различий, (р) OR (95% CI)
ДМПП (n=48) Контроль (n=232)
187P 0,781 0,774 0,87 0,96 (0,56−1,63)
187S 0,219 0,226
Генотипы Частоты генотипов
n % n %
187PP 28 58,3 141 60,8 0,88 1,11 (0,59−2,08)
187PS 19 39,6 77 33,2 0,49 1,32 (0,70−2,50)
187SS 1 2,1 14 6,0 0,45 0,48 (0,09−2,63)
Мальчики с ДМПП (n=15) и здоровые отцы (n=86)
187PP 9 60,0 46 53,5 0,85 0,79 (0,27−3,32)
187PS 5 33,3 33 38,4 0,93 0,84 (0,27−2,56)
187SS 1 6,7 7 8,1 0,75 1,10 (0,17−6,91)
Девочки с ДМПП (n=33) и здоровые матери (n=146)
187PP 19 57,6 95 65,1 0,42 1,37 (0,64−2,96)
187PS 14 42,4 44 30,1 0,17 1,71 (0,79−3,71)
187SS 0 0 7 4,8 0,43 0,28 (0,02−4,98)
Список литературы:
1. Бакиров Б. А., Каримов Д. О., Гончарова О. В. Анализ полиморфных вариантов протоонкогенов, генов апоптоза и факторов роста у больных с неход-жкинскими лимфомами // Казанский медицинский журнал. — 2011. — Т. 92, № 6. — С. 799−804.
2. Jaffe E., Harris N., Stein H. World Health Organization Classification of Tumours: Pathology and Genetics of Tumours of Haematopoietic and Lymphoid Tissues // IARC Press: Lyon — 2001. — Vol. 12. — P. 12−17.
3. Hoffman J., Kaplan S. The incidence of congenital heart disease // Journal of the American College of Cardiology. — 2002. — Vol. 39. — P. 1890−1900.
РОЛЬ ПОЛИМОРФИЗМА P187S ГЕНА NQO1 В РАЗВИТИИ ВРОЖДЕННОГО ДЕФЕКТА МЕЖЖЕЛУДОЧКОВОЙ ПЕРЕГОРОДКИ СЕРДЦА В КРАСНОДАРСКОМ КРАЕ
Швецов Ярослав Дмитриевич
Заочный аспирант кафедры биологии, медицинской генетики и экологии Курского государственного медицинского университета, г. Курск
Лазарев Константин Юрьевич К. м. н., доцент кафедры биологии с курсом медицинской генетики Кубанского государственного медицинского университета, г. Краснодар
Полоников Алексей Валерьевич Д.м.н., профессор кафедры биологии, медицинской генетики и экологии Курского государственного медицинского университета, г. Курск

ПоказатьСвернуть
Заполнить форму текущей работой